質(zhi)控質(zhi)控是(shi)測序(xu)數(shu)據(ju)分(fen)析(xi)的第壹(yi)步(bu)，目的是去(qu)除(chu)低(di)質(zhi)量的序(xu)列，減(jian)少(shao)後(hou)續(xu)分析(xi)的誤差。常(chang)用(yong)的質(zhi)控方法有使用(yong)軟(ruan)件進行質(zhi)量評估(gu)，去(qu)除(chu)低(di)質(zhi)量序(xu)列，去(qu)除(chu)含有接頭(tou)序(xu)列和(he)引(yin)物(wu)序(xu)列的序(xu)列等。

 

　　去(qu)除(chu)低(di)質(zhi)量序(xu)列去(qu)除(chu)低(di)質(zhi)量序(xu)列是(shi)質(zhi)控的壹個重要步(bu)驟。低(di)質(zhi)量序(xu)列可(ke)能由(you)於測序(xu)儀的誤差、PCR擴(kuo)增的偏(pian)差、DNA片(pian)段的不(bu)均壹(yi)性(xing)等原(yuan)因產(chan)生(sheng)。去(qu)除(chu)低(di)質(zhi)量序(xu)列可(ke)以(yi)提(ti)高後(hou)續(xu)分析(xi)的準(zhun)確性和(he)可(ke)靠性。

 

　　拼接(jie)拼接(jie)是指(zhi)將測序(xu)得到的短序(xu)列拼接(jie)成長(chang)序(xu)列。拼接(jie)需(xu)要考(kao)慮(lv)到序(xu)列長(chang)度、重疊區域(yu)、誤差率(lv)等因(yin)素(su)。常(chang)用(yong)的拼接(jie)軟件(jian)有FLASH、PANDAseq等。

 

　　比對比對是(shi)將拼接(jie)後(hou)的序(xu)列與(yu)已知(zhi)的參(can)考序(xu)列進(jin)行比較(jiao)，以(yi)確定序(xu)列的來(lai)源(yuan)、相似性和(he)變(bian)異(yi)情(qing)況。比對可(ke)以(yi)使用(yong)BLAST、Bowtie、BWA等軟(ruan)件(jian)進(jin)行。

 

　　註釋(shi)註釋(shi)是(shi)將序(xu)列的生物(wu)學意義(yi)與已(yi)知(zhi)的生物(wu)學信息(xi)進行關(guan)聯，以(yi)確定序(xu)列的功(gong)能和(he)意(yi)義。註釋(shi)可(ke)以(yi)使用(yong)基(ji)因(yin)組註釋(shi)工具、基(ji)因(yin)組瀏(liu)覽(lan)器等軟(ruan)件(jian)進(jin)行。

 

　　總之，ABI_3730XL測序(xu)儀的數(shu)據(ju)分(fen)析(xi)流程(cheng)是(shi)壹(yi)個復雜的過(guo)程(cheng)，需(xu)要使(shi)用(yong)多種軟件和(he)方法進(jin)行處(chu)理(li)和(he)分(fen)析(xi)。通過(guo)對測序(xu)數(shu)據(ju)的質(zhi)控、去(qu)除(chu)低(di)質(zhi)量序(xu)列、拼接(jie)、比對和(he)註釋(shi)等步(bu)驟，可以(yi)獲(huo)得高質(zhi)量、可靠(kao)的測序(xu)數(shu)據(ju)，為(wei)後(hou)續(xu)的研究(jiu)提(ti)供(gong)有力支持。